オックスフォードに住むアリスは妹たちに自分の創った物語を聞かせていた。
そこへ洋服を着たおかしなウサギが現れ、アリスはそれを追いかけて木の根元に空いていた不気味な大穴へ飛び込んでしまう。
すると穴の中には、アリスが今まで見たことがない不思議な世界が広がっていた。
そこで同じようにこの世界に迷い込んだ小説家のチャールズと出会い、二人は摩訶不思議な冒険へと旅立つ。
そこにはハートを失くしたハートの女王、イカれたフリした帽子屋、自由気ままでセクシーなチェシャ猫など個性豊かな不思議の国の住人たちがアリスの到着を今か今かと待ちわびていた…。